早在 2006 年北京协和医院在国内率先设立痛风专科门诊，曾学军教授曾先后组织并参与多个降尿酸的上市前后研究。课题组是国内蕞早开展规范化关节穿刺核实临床诊断痛风的团队，多次获得行业基金等项目支持开展高尿酸血症和痛风的相关研究，开展流行病学、医生诊疗行为医学、疾病治 疗规范制订与推广、以及卫生经济学等研究。
北京协和医院风湿免疫科为了促进中国风湿病的普及与提高，自建科以来，坚持每年举办形式多样的风湿病学讲习班和学术会议，编著多部风湿病学专著，同时结合风湿病学临床的需要开展科学研究，取得了极大的成绩，是国家教委风湿病学博士学位授予点、风湿免疫内科博士后流动站、国家教委风湿病学重点学科单位、卫生部住院医师培训基地、风湿免疫科专科继续教育基地、风湿临床试验基地、教育部重点实验室，风湿病学博士生/博士后培养单位，为全国培养了大量风湿病学的专业人才。
近年来，得益于国家对风湿免疫病投入逐步增加，在SLE科技支撑计划/863项目、自身免疫性疾病新药临床评价研究技术平台科技重大专项、卫计委行业科研专项等支持下，以北京协和医院牵头，联合全国近800家风湿病诊治中心，已初步形成系统性红斑狼疮研究协作组（CSTAR）和国家风湿病数据中心（CRDC）的研究网络，成为国内的风湿病研究协作组织，创建了中国风湿病信息数据库、生物样本库（CRIP）和规范化培训和多学科交流平台（CREP），启动了中国风湿病学界的多中心协作研究，发布了中国风湿病学界的规范化诊治共识。
北京协和医院风湿免疫科科室承担或参与完成了数十项国家和部委的科研课题，主持和参与众多国际、国内多中心临床研究以及高质量单中心临床研究，发表数百篇SCI收录论文，主持制定多项风湿免疫病领域临床诊断和指南，先后获得12项国家及省部级奖励，包括3项国家科技进步奖，出版学术专著多部。为开展具有管理科学、规范的、符合国际一 流水平的全国大规模多中心自身免疫病临床研究奠定了坚实的基础。