预付款融资通常是基于核心企业的业务进行，核心企业是属于生产型企业，下游采购商给核心企业下订单，需要预支付订单全额，核心企业收到货款后再进行生产。
此时如果采购缺资金情况则无法进行下订单。
在这个基础上，金融机构介入在供应链环节中，提供预付款融资产品。
采购商只需要支付一定比例的保证金，剩余资金由金融机构进行垫付。
在生产完成，货权控制在核心企业手中，采购商在进行提货时，必须先还款给金融机构，金融机构开具放货通知单。
核心企业接收到放货通知单再进行放货。
如果下游采购商违约，则需要由核心协助金融机构处理货物，将货物处置完成后的资金，再还款给金融机构。
预付款融资交易结构（根据金融机构要求会有不同的改动）
预付款融资模式主要是以生产型企业为主，金融机构已经介入到供应链环节中，核心企业协助金融机构完成整个融资流程。
根据各供应链融资模式的应用环节不同。
可以将供应链融资模式分为应收账款融资模式、预付账款融资模式、存货融资模式；
根据参与主体中“第三方金融机构”的实质是独立于供应链的商业银行还是核心企业自营金融子公司。
又可将供应链融资模式分为银企合作的供应链融资模式和自营供应链融资模式。
供应链理论将企业的经营看作是一个价值增值的过程，主张上下游企业之间的合作，将竞争战略理论实用化。供应链金融从资金流角度上将供应链节点上的参与主体联系在一起，搭建了新型的战略合作关系。
中小企业作为一种特殊的企业群体，对经济增长贡献具有巨大的作用，但由于其自身规模的限制，融资难已成为中小企业发展普遍存在的一大困境。
中小企业在信贷市场处于不利地位，其根源在于中小企业信用的先天性缺陷和先天性规模小，缺乏同大企业相比的信贷融资所必须的信息优势，金融机构的结构调整并不能提升中小企业整体的信用水平，并不能从根本上克服中小企业在信贷市场上的不利地位。